Франческо Граначчи учился в мастерской Доменико Гирландайо и помогал ему в написании его картин, используя вместо темперы масляные краски. По заказу Лоренцо Медичи Граначчи участвовал в росписи флорентийского Сан-Марко. Позднее он работал с Леонардо да Винчи, Микеланджело и Рафаэлем.В 1508 г. Граначчи переехал в Рим, где вместе с другими художниками помогал Микеланджело в росписи Сикстинской капеллы.
На стиль Граначчи оказали влияние Филиппино Липпи и Фра Бартоломео.
Граначчи упоминается в «Жизнеописаниях художников» Джорджо Вазари.