Родился в 1945 году в г. Новосибирске. Живет в г. Электросталь Московской области. После школы учился в Художественном училище «Памяти 1905 года» на живописном отделении. В 1975 году закончил графический факультет Московского государственного художественного института им. В.И. Сурикова (мастерскую плаката профессора Н.А. Пономарева), где его педагогами были художники Ю.П. Рейнер, М.Н. Алексич, О.М Савостюк.
С 1975 года постоянный участник российских, всесоюзных и зарубежных выставок. Совместно с художниками Л.И. Петрушиным и А.И. Солоповым создал живописное панно к художественным выставкам в московском Манеже. С 1975 года член Московской областной организации Союза художников России.
В 1995 году перевелся в Московский Союз художников (Объединение художников графического станкового искусства).
Работы А.М. Махоткина находятся в Государственном Русском музее, в собраниях СХ СССР, СХ РСФСР, Министерства культуры РФ, в Музее А. Герасимова в г. Мичуринске и других, а также в частных коллекциях Германии, Англии, Франции, Японии, Южной Кореи, США, Таиланда и др. стран.